Para asegurar la protección de los AVC se crean áreas dentro del patrimonio cuyo objetivo principal es el resguardo, protección o mejora de los Altos Valores de Conservación.

Estas áreas se denominan Áreas de Alto Valor de Conservación (AAVC).

Tantos las AAVC como los AVC pueden ser clasificados en BIOLÓGICOS, SOCIOAMBIENTALES y CULTURALES

Existen 6 categorías para la identificación de los AVC

AVC 1: Diversidad de especies Concentraciones de diversidad biológica que contengan especies endémicas o especies raras, amenazadas o en peligro de extinción, y que son de importancia significativa a escala global, regional o nacional

AVC 2: Ecosistemas y mosaicos a escala de paisaje Ecosistemas y mosaicos de ecosistemas de gran tamaño a escala de paisaje e importantes a escala global, regional o nacional, y que contienen poblaciones viables de la gran mayoría de las especies presentes de manera natural bajo patrones naturales de distribución y abundancia.

AVC 3: Ecosistemas y hábitats Ecosistemas, hábitats o refugios raros, amenazados o en peligro.

AVC 4: Servicios ecosistémicos Servicios básicos del ecosistema en situaciones críticas, como la protección de áreas de captación de agua.

AVC 5: Sitios y recursos fundamentales para satisfacer las necesidades básicas de comunidades
locales.

AVC 6: Valores culturales: Sitios, recursos, hábitats y paisajes significativos por razones culturales, históricas o arqueológicas a escala global o nacional, o de importancia cultural, ecológica, económica, o religiosa o sagrada crítica para la cultura tradicional de las comunidades locales o pueblos indígenas.

AAVC Biológicas: Se han identificado 37 AAVC con a lo menos  un Alto Valor de Conservación por área.

AAVC Socioambientales: Se han identificado 19 AAVC las cuales están en constante revisión y actualización

AAVC Culturales: En conjunto con las comunidades se han identificado 71 AVC Culturales en el patrimonio, los cuales se clasifican en sitios ceremoniales, histórico culturales y de recolección.